RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 GDF15Q99988 308 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 LCHNA4D1U4 455 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 M0QZQ0 153 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 TACC1O75410 805 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 FECHP22830 423 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF132P52740 706 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 RABGGTBP53611 331 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 CCZ1BP86790 482 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 PTK2Q05397 1052 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 TRAPPC3O43617 180 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 SERPING1P05155 500 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 PDGFRBP09619 1106 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 ODC1P11926 461 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 PAX3P23760 479 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 LMO2P25791 158 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 PRKCIP41743 596 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 RAD23BP54727 409 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 FIBCD1Q8N539 461 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.77□□□□□ -0.84
EFTUD2-223ENST00000592576 A8MXQ7 604 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CAPN15O75808 1086 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC172P0C7W6 258 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CYP11B1P15538 503 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CDK17Q00537 523 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 FUT10Q6P4F1 479 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 OSTM1Q86WC4 334 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TTC39CQ8N584 583 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC112Q8NEF3 446 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC20A1Q8WUM9 679 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 IGSF21Q96ID5 467 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF558Q96NG5 402 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SNX25Q9H3E2 840 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 GABRDO14764 452 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 LINC00271P0C7V0 271 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 MYOGP15173 224 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 LAG3P18627 525 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 MTF1Q14872 753 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 B3GALT6Q96L58 329 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 GNA15P30679 374 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 PDE6CP51160 858 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TAF3Q5VWG9 929 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 ACOT1Q86TX2 421 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 C12orf29Q8N999 325 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CYP11A1P05108 521 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CD19P15391 556 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 RGS19P49795 217 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 BPIFB4P59827 614 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 UNC93AQ86WB7 457 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CEP57Q86XR8 500 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TFAP2BQ92481 460 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC42Q96M95 316 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 DSEQ9UL01 958 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 TRANK1O15050 2925 aa9.76□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 NRDCO43847 1150 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM163BP0C2L3 166 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 LHX1P48742 406 aa9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
EFTUD2-223ENST00000592576 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms