RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP14Q86W24 1093 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR49Q8IV35 697 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PGM2Q96G03 612 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX24Q9Y343 169 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.79□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0B4J269 797 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 FSCN2O14926 492 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PROSCO94903 275 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM107AO95990 144 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 AGTP01019 485 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CALB1P05937 261 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PYGMP11217 842 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RARGP13631 454 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ATF2P15336 505 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ITIH2P19823 946 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GLRA2P23416 452 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GNA15P30679 374 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RDXP35241 583 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GSK3AP49840 483 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCY1A3Q02108 690 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 LMNB2Q03252 620 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PTK6Q13882 451 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TFDP1Q14186 410 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 METTL7BQ6UX53 244 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 MON1BQ7L1V2 547 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GPC2Q8N158 579 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GLG1Q92896 1179 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 ART4Q93070 314 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM143Q96AN5 459 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CENPTQ96BT3 561 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 SNF8Q96H20 258 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.845e-10■■■■■ 67.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP83Q9Y592 693 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.78□□□□□ -0.84
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35F4A4IF30 521 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 E7EVH7 732 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCY3O60266 1144 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 MAFO75444 373 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 TOM1L1O75674 476 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A27O95847 323 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 RARAP10276 462 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 EDNRBP24530 442 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 STAT5BP51692 787 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX10P56693 466 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT17Q04695 432 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 DRP2Q13474 957 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 NCOA4Q13772 614 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 IER5Q5VY09 327 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 LBX2Q6XYB7 198 aa9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
EFTUD2-222ENST00000592408 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms