RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNF181	Q9P0P0	153 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMX2	Q9Y320	296 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANO9	A1A5B4	782 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC78	A2IDD5	438 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AHRR	A9YTQ3	701 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494		E9PLN8	166 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOR1B	O14657	336 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM24	O15164	1050 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDUFA10	O95299	355 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRP	P07492	148 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADAM17	P78536	824 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM189B	P81408	668 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	MXRA7	P84157	204 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	FMO1	Q01740	532 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	OCA2	Q04671	838 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC13A2	Q13183	592 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC15A4	Q8N697	577 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL17D	Q8TAD2	202 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANKS1A	Q92625	1134 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	APIP	Q96GX9	242 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNIP3	Q96KP6	325 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR20	Q99678	358 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81	3e-6	■■■□□ 15.8
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFT140	Q96RY7	1462 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	UNC119B	A6NIH7	251 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	ISM1	B1AKI9	464 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYO1F	O00160	1098 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PEX14	O75381	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHEK2	O96017	543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	HLA-DOA	P06340	250 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1S	P09871	688 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIK3CB	P42338	1070 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	UCP3	P55916	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	REST	Q13127	1097 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CTBP1	Q13363	440 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE4A	Q14139	1066 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPATS1	Q496A3	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	METRNL	Q641Q3	311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF276	Q8N554	614 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUCLG2	Q96I99	432 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	STK31	Q9BXU1	1019 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	GPR35	Q9HC97	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	STK32B	Q9NY57	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	MED16	Q9Y2X0	877 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIF21B	O75037	1637 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM233	B4DJY2	109 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLSCR1	O15162	318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	FRS3	O43559	492 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	RASSF9	O75901	435 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NEDD4L-222	ENST00000588494	DNAJB5	O75953	348 aa		3.73	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms