RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ASB7Q9H672 318 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MAFFQ9ULX9 164 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 DERAQ9Y315 318 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.42□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 USP34Q70CQ2 3546 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ANO9A1A5B4 782 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 KRBA1A5PL33 1030 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PDXKO00764 312 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MAPK13O15264 365 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SPTLC1O15269 473 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PI15O43692 258 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GCNT3O95395 438 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 NFICP08651 508 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CPB1P15086 417 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 AOC1P19801 751 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TYMPP19971 482 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PAX3P23760 479 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MRE11P49959 708 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 WNT7BP56706 349 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PNOCQ13519 176 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MORC3Q14149 939 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CENPPQ6IPU0 288 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MTSS1LQ765P7 747 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 USP37Q86T82 979 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR152Q8TDT2 470 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ING5Q8WYH8 240 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SENP8Q96LD8 212 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PHOX2BQ99453 314 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CORO1BQ9BR76 489 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 DPP3Q9NY33 737 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CA14Q9ULX7 337 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 C2CD2Q9Y426 696 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 F5P12259 2224 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 OBSL1O75147 1896 aa7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 OR6C75A6NL08 312 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 H0Y858 1186 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 STK25O00506 426 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF197O14709 1029 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 EXTL3O43909 919 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MICAL2O94851 1124 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 IL18RAPO95256 599 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 VNN2O95498 520 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CYP11A1P05108 521 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4Q2P0C623 313 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ODC1P11926 461 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TAF6P49848 677 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GPC5P78333 572 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TWF1Q12792 350 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GPR17Q13304 367 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 IQCEQ6IPM2 695 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 EFCAB13Q8IY85 973 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ADSSL1Q8N142 457 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ELMOD1Q8N336 334 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 GPT2Q8TD30 523 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 SAAL1Q96ER3 474 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 BORCS6Q96GS4 357 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 KXD1Q9BQD3 176 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.4□□□□□ -1.22
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms