RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	L1RE1	Q9UN81	338 aa		18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	MTMR11	A4FU01	709 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PTPN2	P17706	415 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CASP4	P49662	377 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	UBE2H	P62256	183 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CLDN10	P78369	228 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PLD1	Q13393	1074 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TRPC3	Q13507	836 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CENPP	Q6IPU0	288 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	DPH6	Q7L8W6	267 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TMC2	Q8TDI7	906 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF516	Q92618	1163 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	EDA	Q92838	391 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	MYADM	Q96S97	322 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM209	Q96SK2	561 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		18.94	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	GPR37L1	O60883	481 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PHACTR2	O75167	634 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	VNN2	O95498	520 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LHX1	P48742	406 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	NTHL1	P78549	312 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZXDA	P98168	799 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	MYL7	Q01449	175 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TSPY1	Q01534	308 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TWF1	Q12792	350 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	DUSP4	Q13115	394 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	YIPF1	Q9Y548	306 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	NOTCH4	Q99466	2003 aa		18.93	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	RHO	P08100	348 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LAMP2	P13473	410 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ATIC	P31939	592 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PRCP	P42785	496 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ADAM9	Q13443	819 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	BIRC3	Q13489	604 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	MTMR3	Q13615	1198 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	IQCE	Q6IPM2	695 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	NXPE3	Q969Y0	559 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ACBD6	Q9BR61	282 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.92	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	IKBKB	O14920	756 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ASGR2	P07307	311 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	KRT13	P13646	458 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PCSK1	P29120	753 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	EPHB3	P54753	998 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ENPEP	Q07075	957 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	STIM1	Q13586	685 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LEMD2	Q8NC56	503 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TSG101	Q99816	390 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CORO1B	Q9BR76	489 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF197	O14709	1029 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	GABRD	O14764	452 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	AKAP3	O75969	853 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R2	P41236	205 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	VAMP7	P51809	220 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	TNNC1	P63316	161 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		18.9	■□□□□ 0.62
ATG13-223	ENST00000577256	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		18.9	■□□□□ 0.62

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