RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CPD	O75976	1380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KIAA0232	Q92628	1395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	USP47	Q96K76	1375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	COL18A1	P39060	1754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431		H3BML4	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC16A6	O15403	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ARIH2	O95376	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ALDH2	P05091	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GNAT2	P19087	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HTR1B	P28222	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ACVRL1	P37023	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC6A9	P48067	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GRM7	Q14831	915 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	VPS72	Q15906	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A1W2PP64	1363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCC6	O95255	1503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EP400	Q96L91	3159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CYR61	O00622	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	UBXN7	O94888	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FGA	P02671	866 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP5J	P18859	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	IL12RB1	P42701	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MAP2K6	P52564	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	RAP2B	P61225	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HHEX	Q03014	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NOG	Q13253	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GBX1	Q14549	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CFHR4	Q92496	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PTPN18	Q99952	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	B3GALT2	O43825	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	GC	P02774	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	AMY1A	P04745	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	CD53	P19397	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	FLT3LG	P49771	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	EPHB4	P54760	987 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRRC28-222	ENST00000561431	DSC2	Q02487	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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