RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERVFC1P60507 584 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAMK1Q14012 370 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA0319Q5VV43 1072 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL23Q86XA0 190 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBR7Q8N806 425 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR6B3Q8NGW1 331 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 AUTS2Q8WXX7 1259 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF576Q9H609 170 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSEQ9UL01 958 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LMO2P25791 158 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLUD2P49448 558 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRE11P49959 708 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 DSG1Q02413 1049 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE3AQ05086 875 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAPGEF1Q13905 1077 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIAA1841Q6NSI8 718 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRCH3Q96II8 777 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTYH3Q9C0H2 523 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNX25Q9H3E2 840 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMGXB4Q9UGU5 601 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 OAZ2O95190 189 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 URODP06132 367 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDGFRBP09619 1106 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM163BP0C2L3 166 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTSAP10619 480 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 NDST1P52848 882 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 INCA1Q0VD86 236 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMC7Q7Z402 723 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMC6Q7Z403 805 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 WHAMMQ8TF30 809 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIK3R5Q8WYR1 880 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM81BQ96LP2 452 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TWNKQ96RR1 684 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCF25Q9BQ70 676 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR88Q9GZN0 384 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK39Q9UEW8 545 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXL5Q9UKA1 691 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa19.94■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CILPO75339 1184 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFX1P22670 979 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 IRS1P35568 1242 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LHX1P48742 406 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ORC1Q13415 861 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF394Q53GI3 561 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKS3Q6ZW76 656 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPATA18Q8TC71 538 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPLX3Q8WVH0 158 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHC3Q92529 594 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM209Q96SK2 561 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 STK33Q9BYT3 514 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TLR9Q9NR96 1032 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP72Q9P209 647 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 A8MXQ7 604 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D4O60343 1298 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LPXNO60711 386 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 LILRB3O75022 631 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXCL14O95715 111 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 GYPCP04921 128 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPL17P18621 184 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPN14Q15678 1187 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMD5Q16401 504 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTXN3Q4LDR2 81 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 FIGNQ5HY92 759 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLPP4Q5VZY2 271 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF280DQ6N043 979 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM270Q6UE05 265 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 THEM5Q8N1Q8 247 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR10T2Q8NGX3 314 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 BAP1Q92560 729 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 JAKMIP2Q96AA8 810 aa19.93■□□□□ 0.78
USP3-AS1-203ENST00000559737 NUP58Q9BVL2 599 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms