RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RUBCN	Q92622	972 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PNMA5	Q96PV4	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	NELL2	Q99435	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LAD1	O00515	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TOM1L1	O75674	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CHRNB1	P11230	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LIG1	P18858	919 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CYP3A5	P20815	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	WEE1	P30291	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CDC25A	P30304	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LRPAP1	P30533	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SCTR	P47872	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MTAP	Q13126	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	VIT	Q6UXI7	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	BCO2	Q9BYV7	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	COL4A2	P08572	1712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SFI1	A8K8P3	1242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749		H7C4K7	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF197	O14709	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC16A4	O15374	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PIGR	P01833	764 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PLS3	P13797	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	RHOQ	P17081	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	PSMC3	P17980	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	VIPR2	P41587	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF131	P52739	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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