RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 GAD1Q99259 594 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ABCB6Q9NP58 842 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 NR2E1Q9Y466 385 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 M0QYV0 167 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CILPO75339 1184 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 AXLP30530 894 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ACLYP53396 1101 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MAMLD1Q13495 774 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 UBR7Q8N806 425 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 USP38Q8NB14 1042 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 WHAMMQ8TF30 809 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MCEEQ96PE7 176 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 BCO2Q9BYV7 579 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.95□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 O00370 1275 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 HOXC8P31273 242 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ATICP31939 592 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CD302Q8IX05 232 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 IFT81Q8WYA0 676 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PBKQ96KB5 322 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.989e-7■■□□□ 12.9
CS-215ENST00000549143 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PADI3Q9ULW8 664 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 A8MXQ7 604 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 SPTLC1O15269 473 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PYGMP11217 842 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MMP8P22894 467 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 GRK4P32298 578 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 RGS7P49802 495 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.94□□□□□ -0.986e-13■■□□□ 11.4
CS-215ENST00000549143 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 AMACRQ9UHK6 382 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 KPNA7A9QM74 516 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 GLI1P08151 1106 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MYBL2P10244 700 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MAP2K2P36507 400 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 GUCY2DQ02846 1103 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TRADDQ15628 312 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ZBTB6Q15916 424 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 EMC1Q8N766 993 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CPXM1Q96SM3 734 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PARVAQ9NVD7 372 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CNTN3Q9P232 1028 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 RNF14Q9UBS8 474 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CCDC151A5D8V7 595 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MED7O43513 233 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 FKTNO75072 461 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 GRAP2O75791 330 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 MICAL2O94851 1124 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 POMCP01189 267 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 LMO2P25791 158 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 TUBB4BP68371 445 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 PAK2Q13177 524 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 CCDC142Q17RM4 750 aa8.93□□□□□ -0.98
CS-215ENST00000549143 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86 ms