RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDSP2-204ENST00000548823 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 C2CD2LO14523 706 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MAPK13O15264 365 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TEX28O15482 410 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 B4GALT3O60512 393 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF623O75123 536 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SOD2P04179 222 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ALDH2P05091 517 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 URODP06132 367 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 KLK7P49862 253 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SMTNP53814 917 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 GPC5P78333 572 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKCQQ04759 706 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 WDR59Q6PJI9 974 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CEP72Q9P209 647 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ATRXP46100 2492 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 H0YCG3 227 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CLIC2O15247 247 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB27AP51159 221 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MTF1Q14872 753 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PPP2R5AQ15172 486 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM150BA6NC51 233 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM170BA6NMN3 283 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC30A4O14863 429 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DDHD2O94830 711 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 C1RP00736 705 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 OATP04181 439 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CDC42EP1Q00587 391 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 URGCPQ8TCY9 931 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 NETO1Q8TDF5 533 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 BAP1Q92560 729 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 NDUFA10O95299 355 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CASP4P49662 377 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PEX3P56589 373 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC35C1Q96A29 364 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PGBD4Q96DM1 585 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 CHP1Q99653 195 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 NRP1O14786 923 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 RFC5P40937 340 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 NPTX2P47972 431 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PDXDC1Q6P996 788 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FGF14Q92915 247 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 MYO6Q9UM54 1294 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM208BQ5VWN6 2430 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms