RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 L1RE1Q9UN81 338 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0C4DFX4 3053 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 CCL16O15467 120 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 CLSTN1O94985 981 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 OR4Q2P0C623 313 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRK-222ENST00000532751 ATICP31939 592 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 POLIQ9UNA4 740 aa23.58■■□□□ 1.37
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PTPRK-222ENST00000532751 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 USTQ9Y2C2 406 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 SEC24AO95486 1093 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 ACBD6Q9BR61 282 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 STX10O60499 249 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.54■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 DUSP4Q13115 394 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF667Q5HYK9 610 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 FOXR2Q6PJQ5 311 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 RNF135Q8IUD6 432 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 CEP63Q96MT8 703 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-222ENST00000532751 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 VNN1O95497 513 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 P4HA1P13674 534 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 PTPN2P17706 415 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRK-222ENST00000532751 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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