RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 DTX3Q8N9I9 347 aa5.02□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 COA7Q96BR5 231 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 PTPN18Q99952 460 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.02□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 RAET1EQ8TD07 263 aa5.01□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.01□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.01□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 TTC39AQ5SRH9 613 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ODR4Q5SWX8 454 aa5□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 TMEM39BQ9GZU3 492 aa5□□□□□ -1.61
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HDAC2-216ENST00000523628 ABCF2Q9UG63 623 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 SWAP70Q9UH65 585 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM29Q9UKF5 820 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 PNMA2Q9UL42 364 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 TESMINQ9Y4I5 508 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 LOC285556D6RIA3 1793 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 FOCADQ5VW36 1801 aa5□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 MYPNQ86TC9 1320 aa4.99□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 PDHXO00330 501 aa4.99□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 KDM1AO60341 852 aa4.99□□□□□ -1.61
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF623O75123 536 aa4.99□□□□□ -1.61
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