RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HERC4-215	ENST00000515753		H3BML4	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	OFD1	O75665	1012 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	AGFG2	O95081	481 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ZFPL1	O95159	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	GNAI3	P08754	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	TYR	P14679	529 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	KCNA2	P16389	499 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	RAB27A	P51159	221 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	GNAI1	P63096	354 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75	1e-6	■■■■□ 20.1
HERC4-215	ENST00000515753	PIGF	Q07326	219 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	KIF22	Q14807	665 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	LNX2	Q8N448	690 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	DDB2	Q92466	427 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	RARB	P10826	455 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	HSPA6	P17066	643 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753		E9PLN8	166 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PROM1	O43490	865 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PEX1	O43933	1283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	GJB1	P08034	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	SRGN	P10124	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HERC4-215	ENST00000515753	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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