RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	OLFM1	Q99784	485 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDUFB5	O43674	189 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LGR5	O75473	907 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GGPS1	O95749	300 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BMP15	O95972	392 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TGFB3	P10600	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	IFITM3	Q01628	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBXN1	Q04323	297 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNK2	Q07912	1038 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DPYS	Q14117	519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NACC1	Q96RE7	527 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	VPS16	Q9H269	839 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65	6e-7	■■■□□ 19.1
SLC38A9-222	ENST00000515159	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DCTN3	O75935	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUDT1	P36639	197 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTK6	Q13882	451 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNG2	Q16589	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	JAML	Q86YT9	394 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	PEX13	Q92968	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	P2RX5	Q93086	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	FMO2	Q99518	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	COG5	Q9UP83	839 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAPN9	O14815	690 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	SUPT3H	O75486	399 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	AQP4	P55087	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CRY1	Q16526	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DDR2	Q16832	855 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALG3	Q92685	438 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	TAF4B	Q92750	862 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SLC38A9-222	ENST00000515159	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms