RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 DSEQ9UL01 958 aa18.3■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R37O75864 691 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 CCNE1P24864 410 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 GABRR2P28476 465 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TAF6P49848 677 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 KCNA1Q09470 495 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ITIH5Q86UX2 942 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 METTL23Q86XA0 190 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 HVCN1Q96D96 273 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 RMDN1Q96DB5 314 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 STRA6Q9BX79 667 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ANK1P16157 1881 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TSC2P49815 1807 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 MYMKA6NI61 221 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 CHADO15335 359 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 RESTQ13127 1097 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 POSTNQ15063 836 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 GPR158Q5T848 1215 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 WSCD1Q658N2 575 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SV2BQ7L1I2 683 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SCN1AP35498 2009 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 LILRB5O75023 590 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 IL18RAPO95256 599 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 FGF19O95750 216 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 GAP43P17677 238 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ATF6P18850 670 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SYT1P21579 422 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 TXLNAP40222 546 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 VEPH1Q14D04 833 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 NCDNQ9UBB6 729 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.27■□□□□ 0.52
HERC3-211ENST00000513325 F5P12259 2224 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 KPNA7A9QM74 516 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 DPYSL4O14531 572 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 GCNT3O95395 438 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 CHRNB1P11230 501 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 SOX9P48436 509 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 WNT7BP56706 349 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 CYP4F8P98187 520 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 GIPC2Q8TF65 315 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 ACCSQ96QU6 501 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 IER2Q9BTL4 223 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 PANK2Q9BZ23 570 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 IL21Q9HBE4 155 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF292O60281 2723 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 TDGF1P13385 188 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 IDEP14735 1019 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 CASP5P51878 434 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 TAF12Q16514 161 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 SV2CQ496J9 727 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 TTC8Q8TAM2 541 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 SPPL2BQ8TCT7 592 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 SAAL1Q96ER3 474 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 MSANTD3Q96H12 275 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 ZNF560Q96MR9 790 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 EPC1Q9H2F5 836 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-211ENST00000513325 TASP1Q9H6P5 420 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms