RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 STK38Q15208 465 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 SV2CQ496J9 727 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 ITIH5Q86UX2 942 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 BRSK2Q8IWQ3 736 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 SYCP3Q8IZU3 236 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 PSMG2Q969U7 264 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 SAAL1Q96ER3 474 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 PANK2Q9BZ23 570 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 PANK4Q9NVE7 773 aa26.64■■□□□ 1.86
ALYREF-203ENST00000511412 SOAT2O75908 522 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 LDHAP00338 332 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 LMNAP02545 664 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 PDILTQ8N807 584 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 E2F7Q96AV8 911 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TRPV5Q9NQA5 729 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 NCANO14594 1321 aa26.63■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 KPNA7A9QM74 516 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 MAN2B1O00754 1011 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FGF19O95750 216 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GARTP22102 1010 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 PNPLA4P41247 253 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TUFMP49411 452 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 VEPH1Q14D04 833 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 MGAT5BQ3V5L5 792 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN23Q96B33 292 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO4Q9UKT5 387 aa26.62■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FAM186AA6NE01 2351 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF263O14978 683 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 WNT7BP56706 349 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 STXBP5Q5T5C0 1151 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 WSCD1Q658N2 575 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD6LQ8IWD5 586 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 LPIN3Q9BQK8 851 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM206Q9H813 350 aa26.61■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 SHISA7A6NL88 538 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GABRR2P28476 465 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 SMARCB1Q12824 385 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF528Q3MIS6 628 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GAREM2Q75VX8 874 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 YAF2Q8IY57 180 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 SPPL2BQ8TCT7 592 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 BORCS6Q96GS4 357 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CBWD1Q9BRT8 395 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 TNMDQ9H2S6 317 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 PIAS3Q9Y6X2 628 aa26.6■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 SPTLC2O15270 562 aa26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ITGB3P05106 788 aa26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ATF6P18850 670 aa26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8IPA6NC78 632 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GOLGA8JA6NMD2 632 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 EXTL3O43909 919 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 PPP6R2O75170 966 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 CDR1P51861 262 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GPR158Q5T848 1215 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 FAM3CQ92520 227 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 RSPRY1Q96DX4 576 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 GCNAQ96QF7 691 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 MKNK1Q9BUB5 465 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.58■■□□□ 1.85
ALYREF-203ENST00000511412 ARNTLO00327 626 aa26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 KINO60870 393 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 CUEDC2Q9H467 287 aa26.57■■□□□ 1.84
ALYREF-203ENST00000511412 PCIF1Q9H4Z3 704 aa26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms