RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PARVAQ9NVD7 372 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 POLIQ9UNA4 740 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD2Q9Y426 696 aa8.71□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM187AA6NFU0 413 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GPR32O75388 356 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CALB1P05937 261 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GRM5P41594 1212 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DR1Q01658 176 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CD302Q8IX05 232 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TFAP2BQ92481 460 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RAB17Q9H0T7 212 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HAS3O00219 553 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PSTPIP1O43586 416 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 IGHA2P01877 340 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PAEPP09466 180 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GRK4P32298 578 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MAN1A1P33908 653 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM17P78536 824 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 16.6
PDE4D-208ENST00000502484 MFSD10Q14728 455 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 KIZQ2M2Z5 673 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 TRIB2Q92519 343 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SH3GL2Q99962 352 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SDCBP2Q9H190 292 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 Q9Y3F1 56 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FSCN2O14926 492 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 DAPK3O43293 454 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 MED7O43513 233 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HSF2BPO75031 334 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RNF40O75150 1001 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FGFR4P22455 802 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2C19P33261 490 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RAP1GAPP47736 663 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CPT1AP50416 773 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 GUCY2FP51841 1108 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 JAMLQ86YT9 394 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 IQCKQ8N0W5 287 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 TRIM51Q9BSJ1 452 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.7□□□□□ -1.02
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PDE4D-208ENST00000502484 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CILPO75339 1184 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 HMGCRP04035 888 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 RARAP10276 462 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2C9P11712 490 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 P4HA1P13674 534 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 PTGIRP43119 386 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4D-208ENST00000502484 FNTAP49354 379 aa8.69□□□□□ -1.02
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