RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WDR49Q8IV35 697 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C12orf56Q8IXR9 622 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HS6ST3Q8IZP7 471 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ELMOD1Q8N336 334 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRC52Q8N7C0 313 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CXorf38Q8TB03 319 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CGRRF1Q99675 332 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNK12Q9HB15 430 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 L1RE1Q9UN81 338 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 YIPF1Q9Y548 306 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.02□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MTMR11A4FU01 709 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LAMP2P13473 410 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPN2P17706 415 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYO1EQ12965 1108 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPR17Q13304 367 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNB1Q14721 858 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC5A9Q2M3M2 681 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEP135Q66GS9 1140 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RTL10Q7L3V2 364 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF516Q92618 1163 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FGF13Q92913 245 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HPDLQ96IR7 371 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLSTN2Q9H4D0 955 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEP72Q9P209 647 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDH7Q9ULB5 785 aa13.01□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIOO75962 3097 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDXKO00764 312 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HCRTO43612 131 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NARSO43776 548 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CALUO43852 315 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHACTR2O75167 634 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLSTN1O94985 981 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MBD3O95983 291 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POU2F2P09086 479 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYL4P12829 197 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEBPBP17676 345 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ALDH1A3P47895 512 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TDGQ13569 410 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IQCEQ6IPM2 695 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CENPPQ6IPU0 288 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OSTM1Q86WC4 334 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPAS3Q8IXF0 933 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBALD2Q8IYN6 164 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRF2Q8IZF7 708 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MCRS1Q96EZ8 462 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MFSD14AQ96MC6 490 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DMAC2Q9NW81 257 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAFFQ9ULX9 164 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TECTAO75443 2155 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF20AO95235 890 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GJA1P17302 382 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCR2P41597 374 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DLG4P78352 724 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSPY1Q01534 308 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 BIRC3Q13489 604 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRPC3Q13507 836 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HTR4Q13639 388 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC142Q17RM4 750 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MGAT5BQ3V5L5 792 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ISM2Q6H9L7 571 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PARM1Q6UWI2 310 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.99□□□□□ -0.33
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM200AQ8TCP9 573 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms