RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MAML1Q92585 1016 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MED15Q96RN5 788 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SMOQ99835 787 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 KLC2Q9H0B6 622 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 COL20A1Q9P218 1284 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 PADI4Q9UM07 663 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TMX2Q9Y320 296 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.07□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 A0A087WWL8 130 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 A0A1B0GTW7 788 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MUSKO15146 869 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 ZNF185O15231 689 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 KIF20AO95235 890 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 ADRB1P08588 477 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FGFR4P22455 802 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 STT3AP46977 705 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MICU3Q86XE3 530 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 OR2C3Q8N628 320 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SLC15A4Q8N697 577 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.06□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 POM121BA6NF01 834 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 F8W8V4 182 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RPS6KA4O75676 772 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TSHRP16473 764 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 ZNF20P17024 532 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FDXRP22570 491 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TNFSF4P23510 183 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SERPINB3P29508 390 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 UCP3P55916 312 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 BTKQ06187 659 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 LONRF3Q496Y0 759 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RABL3Q5HYI8 236 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MPP5Q8N3R9 675 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 DEPTORQ8TB45 409 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SGCZQ96LD1 299 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TRIB1Q96RU8 372 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 ETAA1Q9NY74 926 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RNF181Q9P0P0 153 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FNIP2Q9P278 1114 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 XPR1Q9UBH6 696 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 DMTF1Q9Y222 760 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.05□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 GAGE12BA1L429 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 AHRRA9YTQ3 701 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CREB3O43889 395 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 GPANK1O95872 356 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CYP2C9P11712 490 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 VIPR2P41587 438 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 WNT3P56703 355 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 HSD11B2P80365 405 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 OCA2Q04671 838 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 SERHLQ9NQF3 203 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 HESX1Q9UBX0 185 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.04□□□□□ -1.44
CCL20-204ENST00000489160 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms