RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	EXOC3	O60645	756 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KIF20A	O95235	890 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CFH	P08603	1231 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SRF	P11831	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	MYL4	P12829	197 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CEBPB	P17676	345 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TNNI1	P19237	187 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	DUSP4	Q13115	394 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PSMD2	Q13200	908 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SIX5	Q8N196	739 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	GDE1	Q9NZC3	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	OBSL1	O75147	1896 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KLRC4	O43908	158 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PLA2G5	P39877	138 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	MYL7	Q01449	175 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	STK4	Q13043	487 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TAF12	Q16514	161 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PRRX2	Q99811	253 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	KXD1	Q9BQD3	176 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PSMD6	Q15008	389 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CENPP	Q6IPU0	288 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PARM1	Q6UWI2	310 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	FGF14	Q92915	247 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	GCNA	Q96QF7	691 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CEP72	Q9P209	647 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PTPRD	P23468	1912 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	STK25	O00506	426 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PHACTR2	O75167	634 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	SOAT2	O75908	522 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	VNN2	O95498	520 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	PCSK1	P29120	753 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	CDR1	P51861	262 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	BIRC3	Q13489	604 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	TRPC3	Q13507	836 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CHMP3-208	ENST00000486404	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19

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