RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 EFCAB13Q8IY85 973 aa18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 EPC1Q9H2F5 836 aa18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ASB7Q9H672 318 aa18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 C2CD2Q9Y426 696 aa18.31■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP1R37O75864 691 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TDGF1P13385 188 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ATF6P18850 670 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 PAX3P23760 479 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNE1P24864 410 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 GABRR2P28476 465 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ADSSP30520 456 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SOX9P48436 509 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF6P49848 677 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CUL4AQ13619 759 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SLFN12LQ6IEE8 588 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 YAF2Q8IY57 180 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 E2F7Q96AV8 911 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 LMAN1LQ9HAT1 526 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 DPP3Q9NY33 737 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 NCDNQ9UBB6 729 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ASB3Q9Y575 518 aa18.3■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CYB561D2O14569 222 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAMEF12O95522 483 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 WNT7BP56706 349 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP4F8P98187 520 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNA1Q09470 495 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR158Q5T848 1215 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM173BQ6P4H8 233 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 HVCN1Q96D96 273 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CLIC6Q96NY7 704 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TBC1D7Q9P0N9 293 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 STK17AQ9UEE5 414 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 DSEQ9UL01 958 aa18.29■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 MYMKA6NI61 221 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CHADO15335 359 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CHRNB1P11230 501 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 RESTQ13127 1097 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 WSCD1Q658N2 575 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ITIH5Q86UX2 942 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 METTL23Q86XA0 190 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TTC8Q8TAM2 541 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 BORCS6Q96GS4 357 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFYVE19Q96K21 471 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 IER2Q9BTL4 223 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 STRA6Q9BX79 667 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FGF19O95750 216 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CASP5P51878 434 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 GAS6Q14393 721 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 VEPH1Q14D04 833 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR44Q5JSH3 913 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SAAL1Q96ER3 474 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM213AQ9BRX8 229 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 IL21Q9HBE4 155 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SKIV2L-211ENST00000485349 IL18RAPO95256 599 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 PDCP20941 246 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 CCR3P51677 355 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SATB1Q01826 763 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 SV2CQ496J9 727 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.26■□□□□ 0.51
SKIV2L-211ENST00000485349 Q6ZS52 159 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms