RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP40-215ENST00000484528 PSMC3P17980 439 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP40-215ENST00000484528 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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USP40-215ENST00000484528 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
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USP40-215ENST00000484528 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP40-215ENST00000484528 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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