RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MASTLQ96GX5 879 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 LRRCC1Q9C099 1032 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 EMC7Q9NPA0 242 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 C10orf71Q711Q0 1435 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SLX4Q8IY92 1834 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 RTL9Q8NET4 1388 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 LY86O95711 162 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A5Q92911 643 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 CRAMP1Q96RY5 1269 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.7□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PDE8BO95263 885 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 MROH5Q6ZUA9 1318 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 UFL1O94874 794 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PEX11BO96011 259 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 GORABQ5T7V8 394 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 AMER2Q8N7J2 671 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 IL17RAQ96F46 866 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 POLLQ9UGP5 575 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 SLC5A1P13866 664 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRC-211ENST00000484135 PTGS2P35354 604 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PHKA1P46020 1223 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PDE1AP54750 535 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A3Q00325 362 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 RABL3Q5HYI8 236 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-211ENST00000484135 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.67□□□□□ -1.5
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