RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 ZEB2O60315 1214 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PHACTR2O75167 634 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GPR32O75388 356 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CLSTN1O94985 981 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NPTXRO95502 500 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 F11P03951 625 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TUBB4AP04350 444 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NFICP08651 508 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 STAG3L1P0CL83 205 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 AKR1A1P14550 325 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TNFAIP3P21580 790 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SCP2P22307 547 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MSX1P28360 303 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CPT1AP50416 773 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GALCP54803 685 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MFAP3P55082 362 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MYL6P60660 151 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ADAM17P78536 824 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SP3Q02447 781 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GAS6Q14393 721 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NAB2Q15742 525 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 FAM187BQ17R55 369 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 JADE1Q6IE81 842 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SHC3Q92529 594 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 WNT8BQ93098 351 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ASB16Q96NS5 453 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 OSMRQ99650 979 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 EPC1Q9H2F5 836 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 POLIQ9UNA4 740 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NRCAMQ92823 1304 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SCN1AP35498 2009 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF185O15231 689 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TACC1O75410 805 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PALMO75781 387 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 FTCDO95954 541 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MMEP08473 750 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CLTAP09496 248 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 H2AFZP0C0S5 128 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 MCF2P10911 925 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CYP11B1P15538 503 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ABCB4P21439 1286 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 RAP1GAPP47736 663 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 DNA2P51530 1060 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GJA9P57773 515 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 POU5F1BQ06416 359 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ENPEPQ07075 957 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SNX17Q15036 470 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 H2AFVQ71UI9 128 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 USP37Q86T82 979 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 WDR49Q8IV35 697 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 C7orf31Q8N865 590 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 COG1Q8WTW3 980 aa6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SKAP2-204ENST00000481204 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms