RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	DKK1	O94907	266 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CPB1	P15086	417 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	GABRR2	P28476	465 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CSRP3	P50461	194 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CXADR	P78310	365 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	LY6D	Q14210	128 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CRY1	Q16526	586 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CD101	Q93033	1021 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM4	Q9C037	500 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	HIP1	O00291	1037 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	EML1	O00423	815 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SYP	P08247	313 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	AMPD2	Q01433	879 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SEMG2	Q02383	582 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TFDP1	Q14186	410 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	WHAMM	Q8TF30	809 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	MTR	Q99707	1265 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TASP1	Q9H6P5	420 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.99	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ZBTB39	O15060	712 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SOAT2	O75908	522 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	C6	P13671	934 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	HLA-E	P13747	358 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	WEE1	P30291	646 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	EPHB3	P54753	998 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	DUSP4	Q13115	394 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	UROC1	Q96N76	676 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	FZD8	Q9H461	694 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.98	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693		K7EQS6	105 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	SYN3	O14994	580 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	AP5Z1	O43299	807 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	GLRA2	P23416	452 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	IL12RB1	P42701	662 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF33A	Q06730	810 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PLD1	Q13393	1074 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC157	Q569K6	752 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	BEST2	Q8NFU1	509 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	KIF2C	Q99661	725 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	IL21R	Q9HBE5	538 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	PODXL	O00592	558 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	TDP2	O95551	362 aa		11.96	□□□□□ -0.49
HCLS1-204	ENST00000468693	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49

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