RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NFS1Q9Y697 457 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NRCAMQ92823 1304 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ESYT3A0FGR9 886 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 FAM187AA6NFU0 413 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 O00370 1275 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 KRIT1O00522 736 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZEB2O60315 1214 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PHF2O75151 1096 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PAEPP09466 180 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CYP3A5P20815 502 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 IVDP26440 423 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ATICP31939 592 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN7P35236 360 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SLC1A1P43005 524 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DNA2P51530 1060 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 HUNKP57058 714 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TAS2R40P59535 323 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 OGDHQ02218 1023 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 GUCY2DQ02846 1103 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TNFAIP2Q03169 654 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MESDQ14696 234 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CCL14Q16627 93 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF699Q32M78 642 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PKDCCQ504Y2 493 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 UBXN11Q5T124 520 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC38Q5VT99 294 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.452e-7■□□□□ 9.2
PTPRC-210ENST00000462363 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 DPP9Q86TI2 863 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TRPV1Q8NER1 839 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 FAM71BQ8TC56 605 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SNX27Q96L92 541 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 APBA2Q99767 749 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 SETD4Q9NVD3 440 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 AMACRQ9UHK6 382 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NFU1Q9UMS0 254 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NME7Q9Y5B8 376 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 HTTP42858 3142 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PATJQ8NI35 1801 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 LCE2BO14633 110 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TTI1O43156 1089 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 THAP12O43422 761 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PSTPIP1O43586 416 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 PPFIA2O75334 1257 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TNNC2P02585 160 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 WEE2P0C1S8 567 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RARAP10276 462 aa6□□□□□ -1.45
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PTPRC-210ENST00000462363 GGCXP38435 758 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 NSFP46459 744 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 GABRB2P47870 512 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TM4SF4P48230 202 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 FNTAP49354 379 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RWDD2BP57060 319 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 IGBP1P78318 339 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CDC42EP1Q00587 391 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-210ENST00000462363 CAP1Q01518 475 aa6□□□□□ -1.45
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