RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452236.2

ZBED9-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED9, Length 4,877 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9-201ENST00000452236 CPP00450 1065 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ATP1A3P13637 1013 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ATP5DP30049 168 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CUL2Q13617 745 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SPTLC3Q9NUV7 552 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MYOM1P52179 1685 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 FBXL16Q8N461 479 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 LRRC37A3O60309 1634 aa13.01□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 LRRC53A6NM62 1247 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ASS1P00966 412 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CSH1P0DML2 217 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CSH2P0DML3 217 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GARSP41250 739 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ORC1Q13415 861 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ABHD15Q6UXT9 468 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SCYL1Q96KG9 808 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ARFGAP3Q9NP61 516 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 I3L4J1 428 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 F9P00740 461 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MX2P20592 715 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 TMC2Q8TDI7 906 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 STK33Q9BYT3 514 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 WDCPQ9H6R7 721 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 OLFML3Q9NRN5 406 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ROBO3Q96MS0 1386 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GSTA1P08263 222 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GSTA2P09210 222 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 HDCP19113 662 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GRIN1Q05586 938 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 AP1B1Q10567 949 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 DPYDQ12882 1025 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 DCUN1D1Q96GG9 259 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZMYND10O75800 440 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 NUP85Q9BW27 656 aa13□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RFC2P35250 354 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CAPSQ13938 189 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 JADE1Q6IE81 842 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 BRSK2Q8IWQ3 736 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 UNC45BQ8IWX7 931 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 TCF25Q9BQ70 676 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 FAM8A1Q9UBU6 413 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 FBXO21O94952 628 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 VPS39Q96JC1 886 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 DOT1LQ8TEK3 1739 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 M0QYT0 321 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 OPA1O60313 960 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SPATA31D3P0C874 917 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CAPN2P17655 700 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CYP24A1Q07973 514 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RAPH1Q70E73 1250 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 PID1Q7Z2X4 250 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 AGPAT1Q99943 283 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 VPS28Q9UK41 221 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 PAMP19021 973 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CASP4P49662 377 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 IQCB1Q15051 598 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ZNF384Q8TF68 577 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RUNDC3BQ96NL0 473 aa12.99□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 EPHB2P29323 1055 aa12.98□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ETFBP38117 255 aa12.98□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
ZBED9-201ENST00000452236 ATPAF2Q8N5M1 289 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms