RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 CREB5Q02930 508 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 EMC2Q15006 297 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 C16orf46Q6P387 395 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 VITQ6UXI7 678 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 KBTBD6Q86V97 674 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 C11orf74Q86VG3 221 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 TPH2Q8IWU9 490 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 TBCKQ8TEA7 893 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 GJA10Q969M2 543 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 LENG9Q96B70 501 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 FAM20AQ96MK3 541 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 UROC1Q96N76 676 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 CEP89Q96ST8 783 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 EDEM2Q9BV94 578 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 TMEM9BQ9NQ34 198 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 ASAH2Q9NR71 780 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 MAFFQ9ULX9 164 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.65□□□□□ -1.5
CBX1-204ENST00000444685 FRYQ5TBA9 3013 aa5.65□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.65□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.65□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ARHGEF37A1IGU5 675 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 N4BP3O15049 544 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ADAM12O43184 909 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 KIF4AO95239 1232 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 FGF19O95750 216 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 IL2RAP01589 272 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 IGHDP01880 384 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 FGFR3P22607 806 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CYP3A7P24462 503 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 GBP1P32455 592 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 NR5A1Q13285 461 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 PLD1Q13393 1074 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 KRT32Q14532 448 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 PON2Q15165 354 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 UAP1L1Q3KQV9 507 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 TPGS2Q68CL5 300 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 C4orf19Q8IY42 314 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 GSTCDQ8NEC7 633 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ZSWIM3Q96MP5 696 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 MTRRQ9UBK8 725 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 BRPF3Q9ULD4 1205 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 USP3Q9Y6I4 520 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ZZEF1O43149 2961 aa5.64□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 MYBPHLA2RUH7 354 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 LRRIQ4A6NIV6 560 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SHISA7A6NL88 538 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 H0Y626 953 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CDK2AP1O14519 115 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 GIPC1O14908 333 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ABLIM3O94929 683 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 TRIM16O95361 564 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ADH1CP00326 375 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 SPINK2P20155 84 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 FCARP24071 287 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 CDC27P30260 824 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ALDH1A3P47895 512 aa5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CBX1-204ENST00000444685 EPHB3P54753 998 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms