RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PODNQ7Z5L7 613 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 POC5Q8NA72 575 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CEP170P1Q96L14 293 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MMS19Q96T76 1030 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 THTPAQ9BU02 230 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 BTBD3Q9Y2F9 522 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 A8MX80 341 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 CA4P22748 312 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 VAMP1P23763 118 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SMCO1Q147U7 214 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.84□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.84□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 H3BUI4 141 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 LRRC24Q50LG9 513 aa5.83□□□□□ -1.48
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PTPRC-209ENST00000442510 KLHL35Q6PF15 583 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 SYCE2Q6PIF2 218 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 BEND5Q7L4P6 421 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 NATD1Q8N6N6 113 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 AGR3Q8TD06 166 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRC-209ENST00000442510 UCMAQ8WVF2 138 aa5.83□□□□□ -1.48
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