RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	19.19	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		19.19	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4Q2	P0C623	313 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ODC1	P11926	461 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	GART	P22102	1010 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT7B	P56706	349 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TWF1	Q12792	350 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	HSCB	Q8IWL3	235 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF1	Q9Y548	306 aa		19.18	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF197	O14709	1029 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	MOSPD3	O75425	235 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	IL18RAP	O95256	599 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	LMNB2	Q03252	620 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TSSK4	Q6SA08	328 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CUEDC2	Q9H467	287 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	DPP3	Q9NY33	737 aa		19.17	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	MTMR11	A4FU01	709 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	SHISA7	A6NL88	538 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CUTA	O60888	179 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	F13A1	P00488	732 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TGM1	P22735	817 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	FCAR	P24071	287 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF6	P49848	677 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCE	Q6IPM2	695 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPP	Q6IPU0	288 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	SHC4	Q6S5L8	630 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ELMOD1	Q8N336	334 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	LEMD2	Q8NC56	503 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	DNASE1L2	Q92874	299 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM209	Q96SK2	561 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC3	Q9BY71	257 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM9	Q9C026	710 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM206	Q9H813	350 aa		19.16	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	DUSP4	Q13115	394 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	MTAP	Q13126	283 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	SAAL1	Q96ER3	474 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	DSE	Q9UL01	958 aa		19.15	■□□□□ 0.66
MRPL28-203	ENST00000429738	MAN2B1	O00754	1011 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	PLD1	Q13393	1074 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC8	Q8IU68	726 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CXorf38	Q8TB03	319 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB16	Q96NS5	453 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ASAH2	Q9NR71	780 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	USP18	Q9UMW8	372 aa		19.14	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB561D2	O14569	222 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	EXTL3	O43909	919 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	NRL	P54845	237 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	PKP1	Q13835	747 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	IQUB	Q8NA54	791 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	DHX58	Q96C10	678 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	RTKN	Q9BST9	563 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	CHRD	Q9H2X0	955 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	BRD9	Q9H8M2	597 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	19.13	■□□□□ 0.65
MRPL28-203	ENST00000429738	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		19.13	■□□□□ 0.65

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