RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 USP28Q96RU2 1077 aa22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 FRYLO94915 3013 aa22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF292O60281 2723 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 NCANO14594 1321 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ARNTLO00327 626 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CYB561D2O14569 222 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GARTP22102 1010 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GDI1P31150 447 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 KCNA1Q09470 495 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SV2CQ496J9 727 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 METTL23Q86XA0 190 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MSANTD3Q96H12 275 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF560Q96MR9 790 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.67■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GCNT3O95395 438 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 WEE1P30291 646 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PNPLA4P41247 253 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 VIPR2P41587 438 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 STAT6P42226 847 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 NELL1Q92832 810 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 OBP2AQ9NY56 170 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.66■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA7A9QM74 516 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF263O14978 683 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CHADO15335 359 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 STX6O43752 255 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 KINO60870 393 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CASP5P51878 434 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GAREM2Q75VX8 874 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 BACH2Q9BYV9 841 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087X0B3 334 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ATF6P18850 670 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 VEPH1Q14D04 833 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.64■■□□□ 1.21
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM206Q9H813 350 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.64■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SOAT2O75908 522 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 IDEP14735 1019 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 GABRR2P28476 465 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FOXK2Q01167 660 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 WSCD1Q658N2 575 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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LIMS1-208ENST00000428064 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAM3CQ92520 227 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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LIMS1-208ENST00000428064 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.63■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PANK4Q9NVE7 773 aa22.63■■□□□ 1.21
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LIMS1-208ENST00000428064 EXTL3O43909 919 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 PPP6R2O75170 966 aa22.62■■□□□ 1.21
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LIMS1-208ENST00000428064 WNT7BP56706 349 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 YAF2Q8IY57 180 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA18Q8TC71 538 aa22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LIMS1-208ENST00000428064 RUBCNQ92622 972 aa22.62■■□□□ 1.21
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