RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 FSHRP23945 695 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 RPL13P26373 211 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP4Q13115 394 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAM9Q13443 819 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 BIRC3Q13489 604 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPC3Q13507 836 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ATAD1Q8NBU5 361 aa26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 EEF2KMTQ96G04 330 aa26.87■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 TWF1Q12792 350 aa26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 NFIL3Q16649 462 aa26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 OSTM1Q86WC4 334 aa26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa26.86■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 BIN1O00499 593 aa26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ASGR2P07307 311 aa26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 SOWAHAQ2M3V2 549 aa26.85■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 LRRTM3Q86VH5 581 aa26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 TOP6BLQ8N6T0 577 aa26.85■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 MMS19Q96T76 1030 aa26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 CLSTN1O94985 981 aa26.84■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN2P17706 415 aa26.84■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM186BQ8IYM0 893 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 ADSSL1Q8N142 457 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.84■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 YIPF1Q9Y548 306 aa26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM86C2PA6NEL3 165 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 HCRTO43612 131 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 SOAT2O75908 522 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 VAMP7P51809 220 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 AP3M2P53677 418 aa26.83■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 TSG101Q99816 390 aa26.83■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 CEP72Q9P209 647 aa26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1-202ENST00000425695 NOTCH4Q99466 2003 aa26.83■■□□□ 1.89
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HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK13O15264 365 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 RHOP08100 348 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT13P13646 458 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 MYL7Q01449 175 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY1Q01534 308 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR72Q3MJ13 1102 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf220Q5T0J3 134 aa26.82■■□□□ 1.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 TMLHEQ9NVH6 421 aa26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
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HTATSF1-202ENST00000425695 CETN3O15182 167 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM49P0CI25 452 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM49CP0CI26 452 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDH1A3P47895 512 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 LHX1P48742 406 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 STIM1Q13586 685 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 NCOA4Q13772 614 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN21Q16825 1174 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 IQCEQ6IPM2 695 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 DPH6Q7L8W6 267 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 HS6ST3Q8IZP7 471 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ING5Q8WYH8 240 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ACBD6Q9BR61 282 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 MMRN2Q9H8L6 949 aa26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1-202ENST00000425695 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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