RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399599.7

CDIP1-201, Transcript of cell death inducing p53 target 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDIP1, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1-201ENST00000399599 PDGFRBP09619 1106 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ASPAP45381 313 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 KRT17Q04695 432 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 GRIK4Q16099 956 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 EXOC4Q96A65 974 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 GH1P01241 217 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 SLC29A2Q14542 456 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TCP11Q8WWU5 503 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 RAPGEF5Q92565 580 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CAVIN3Q969G5 261 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MAML3Q96JK9 1138 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 FAM167AQ96KS9 214 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 NIF3L1Q9GZT8 377 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TBK1Q9UHD2 729 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 LRRD1A4D1F6 860 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 F5H423 210 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CCDC188H7C350 402 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 PTGIRP43119 386 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CCT5P48643 541 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 EFNA5P52803 228 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF844Q08AG5 666 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ACVR2BQ13705 512 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ARMC3Q5W041 872 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 KIF12Q96FN5 646 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CPXM1Q96SM3 734 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 RNF39Q9H2S5 420 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.76□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ASB14A6NK59 587 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 PHF2O75151 1096 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 LGR5O75473 907 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CTSHP09668 335 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ANXA13P27216 316 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MNAT1P51948 309 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MCL1Q07820 350 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ERICH1Q86X53 443 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 WDR49Q8IV35 697 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 FZD8Q9H461 694 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CAND2O75155 1236 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ATP11AP98196 1134 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CENPCQ03188 943 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CST9Q5W186 159 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZPBP2Q6X784 338 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 HSPH1Q92598 858 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MIS12Q9H081 205 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 GJD2Q9UKL4 321 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 SNX9Q9Y5X1 595 aa14.75□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 M0QYV0 167 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 KRT1P04264 644 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MYL3P08590 195 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CETPP11597 493 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 CLDN10P78369 228 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 DUPD1Q68J44 220 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 MGARPQ8TDB4 240 aa14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CDIP1-201ENST00000399599 C9orf72Q96LT7 481 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms