RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GGT7Q9UJ14 662 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POU2F3Q9UKI9 436 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SIK3Q9Y2K2 1263 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BLACEA4D250 179 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EDIL3O43854 480 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRAMEF10O60809 474 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OPHN1O60890 802 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EFCAB14O75071 495 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HOXB2P14652 356 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SP100P23497 879 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KCNJ4P48050 445 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FLT3LGP49771 235 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 P2RX3P56373 397 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EIF6P56537 245 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BMPR2Q13873 1038 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NCAPHQ15003 741 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NTRK3Q16288 839 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C9orf57Q5W0N0 161 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STYK1Q6J9G0 422 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ANKRD16Q6P6B7 361 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRILQ7L0X0 811 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CLNKQ7Z7G1 428 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FBXO17Q96EF6 278 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LINC00167Q96N53 147 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC66A2RUB6 948 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBE2Q2LH0YL09 131 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LMX1BO60663 402 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HIP1RO75146 1068 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZBTB25P24278 435 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CDC25CP30307 473 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MLLT10P55197 1068 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GTF2H3Q13889 308 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MYBPC3Q14896 1274 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STPG1Q5TH74 334 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SERINC5Q86VE9 423 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM199Q8N511 208 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FKBP10Q96AY3 582 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PODXL2Q9NZ53 605 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TENM3Q9P273 2699 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ASXL2Q76L83 1435 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GSTA4O15217 222 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SPTLC2O15270 562 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CTIFO43310 598 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POMCP01189 267 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A1BGP04217 495 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CTSAP10619 480 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CYP2C18P33260 490 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PPP2R2AP63151 447 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NOMO3P69849 1222 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NOMO1Q15155 1222 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NOMO2Q5JPE7 1267 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RFX8Q6ZV50 586 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C16orf82Q7Z2V1 217 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ARMC9Q7Z3E5 817 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMC4Q7Z404 712 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLC15A3Q8IY34 581 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PCDH19Q8TAB3 1148 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PGLYRP2Q96PD5 576 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VTI1BQ9UEU0 232 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLSCR5A0PG75 271 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 APOL3O95236 402 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PPP1R3DO95685 299 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 F7P08709 466 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 THBS4P35443 961 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RPS13P62277 151 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PMP22Q01453 160 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ADCY2Q08462 1091 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SHBQ15464 509 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM47CQ5HY64 1035 aa0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms