RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366960.7

RPS6KC1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC30AQ86WT1 665 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 RSAD1Q9HA92 442 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 TPST1O60507 370 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GLI1P08151 1106 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NFKBIAP25963 317 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 HMOX2P30519 316 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 KCNK16Q96T55 309 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 HAO1Q9UJM8 370 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MYL2P10916 166 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 AMHR2Q16671 573 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 URGCPQ8TCY9 931 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 LPAR1Q92633 364 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ASB14A6NK59 587 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SERPINB9P50453 376 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ACER1Q8TDN7 264 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CYGBQ8WWM9 190 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ACAD10Q6JQN1 1059 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 LZICQ8WZA0 190 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 TRIM54Q9BYV2 358 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 TBX20Q9UMR3 447 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAN1A2O60476 641 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP6V1B1P15313 513 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NFIAQ12857 509 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ARHGEF6Q15052 776 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 OTULINQ96BN8 352 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 EXTL3O43909 919 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ENTPD3O75355 529 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GPD1P21695 349 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NSL1Q96IY1 281 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 HEY2Q9UBP5 337 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 AKAP3O75969 853 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 POLBP06746 335 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 INPP5AQ14642 412 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 PJA2O43164 708 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 TMCC1O94876 653 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ITGB3P05106 788 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ATP6V1E1P36543 226 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NNMTP40261 264 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CENPCQ03188 943 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MED15Q96RN5 788 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 NTRK3Q16288 839 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 TTC23LQ6PF05 361 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 MTMR8Q96EF0 704 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS6KC1-202ENST00000366960 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms