RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GJB7Q6PEY0 223 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 STKLD1Q8NE28 680 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC90BQ9GZT6 254 aa21.2■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PDHA1P08559 390 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 COILP38432 576 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ST8SIA6P61647 398 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.982e-6■□□□□ 9.8
CCSAP-203ENST00000366687 LATS2Q9NRM7 1088 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CEP152O94986 1710 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR2P21802 821 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PRUNE1Q86TP1 453 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 OR2W6PQ8NHA6 318 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GOLPH3Q9H4A6 298 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TASP1Q9H6P5 420 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPER1Q8NEC5 780 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GMCL1Q96IK5 515 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 EHD4Q9H223 541 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 KLC4Q9NSK0 619 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ITGB3P05106 788 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC7Q99615 494 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NPHS2Q9NP85 383 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.19■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC78A2IDD5 438 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SEC23AQ15436 765 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RRM2BQ7LG56 351 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 THAP2Q9H0W7 228 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 POLLQ9UGP5 575 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM120BA0PK00 339 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PYGLP06737 847 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CPT1AP50416 773 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZIM3Q96PE6 472 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 VPS33BQ9H267 617 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NPTXRO95502 500 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PON1P27169 355 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SLC15A2Q16348 729 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1257Q9ULG3 409 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 HUNKP57058 714 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 TTI2Q6NXR4 508 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.18■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PRRG1O14668 218 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF263O14978 683 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 GARTP22102 1010 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NAMPTP43490 491 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CD302Q8IX05 232 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 LSP1P33241 339 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 PTGER2P43116 358 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 YAF2Q8IY57 180 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH10BP0C881 870 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 NCAM1P13591 858 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MTFR1Q15390 333 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK16Q96T55 309 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA17Q96L03 361 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 FOPNLQ96NB1 174 aa21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms