RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM52Q8NDY8 209 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 STYXQ8WUJ0 223 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 BHMTQ93088 406 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ISL2Q96A47 359 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf25Q9BPX7 421 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MLXIPQ9HAP2 919 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 BRF2Q9HAW0 419 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS50Q9UI38 385 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CORO2BQ9UQ03 480 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM2Q9UHN6 1383 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A8A0AV02 714 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 H3BNC9 293 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 H7BY64 318 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 WNT10BO00744 389 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FMO6PO60774 539 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 LRIG2O94898 1065 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MT-ND3P03897 115 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PDE6AP16499 860 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ITIH2P19823 946 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CD33P20138 364 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ACTN2P35609 894 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SLC19A1P41440 591 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP4Q13115 394 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 KCNAB2Q13303 367 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FGL2Q14314 439 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ADIPOQQ15848 244 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TEX35Q5T0J7 233 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TAF2Q6P1X5 1199 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF765Q7L2R6 523 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 NEDD1Q8NHV4 660 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ST8SIA4Q92187 359 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ACSBG1Q96GR2 724 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 EYA3Q99504 573 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GPR62Q9BZJ7 368 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 BRD9Q9H8M2 597 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FAM86C1Q9NVL1 165 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RGL1Q9NZL6 768 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MED16Q9Y2X0 877 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 DTNAQ9Y4J8 743 aa2.78□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ADAM20O43506 726 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ZBED4O75132 1171 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PLS3P13797 630 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ECI1P42126 302 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LIMK1P53667 647 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 UBXN2AP68543 259 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 IL10RAQ13651 578 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SURF1Q15526 300 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FIGNQ5HY92 759 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 BORAQ6PGQ7 559 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KRT28Q7Z3Y7 464 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A10Q8TF71 515 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ASIC4Q96FT7 647 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 FOXQ1Q9C009 403 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK4Q9NYG8 393 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 HSPBP1Q9NZL4 362 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 LPAR3Q9UBY5 353 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SRPK3Q9UPE1 567 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PCDH17O14917 1159 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF1O95521 474 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA4LO95757 839 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCBP05771 671 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CKBP12277 381 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 JUPP14923 745 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 GBP1P32455 592 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 ARL4DP49703 201 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 EPS8Q12929 822 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 STARD3Q14849 445 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 MMEL1Q495T6 779 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 CT83Q5H943 113 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZNB5 142 aa2.77□□□□□ -1.97
CCSAP-202ENST00000366686 NUP54Q7Z3B4 507 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms