RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNE4Q8N205 404 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPP5Q8N3R9 675 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHKBQ93100 1093 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TNIP3Q96KP6 325 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBCBQ99426 244 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHST12Q9NRB3 414 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETAA1Q9NY74 926 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 HESX1Q9UBX0 185 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PS29 197 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASA4BC9J798 803 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASA4O43374 803 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF10O60809 474 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPFIA4O75335 1185 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA10O95299 355 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELANEP08246 267 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1SP09871 688 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAG3P18627 525 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLRC1P26715 233 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 VIPR2P41587 438 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TM4SF4P48230 202 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRIM2P49643 509 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC25A3Q00325 362 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MC2RQ01718 297 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SATB1Q01826 763 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 DAG1Q14118 895 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 GEN1Q17RS7 908 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LONRF3Q496Y0 759 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LAYNQ6UX15 382 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SESTD1Q86VW0 696 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC15A4Q8N697 577 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAML1Q92585 1016 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYD88Q99836 296 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMURF2Q9HAU4 748 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 XPR1Q9UBH6 696 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYADML2A6NDP7 307 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 POM121BA6NF01 834 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM233B4DJY2 109 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 E7ENX8 843 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX14O75381 377 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOAT2O75908 522 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDKL5O76039 1030 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUN1O94901 812 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL18RAPO95256 599 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX11BO96011 259 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRB1P08588 477 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYP2C9P11712 490 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSHRP16473 764 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGALP20701 1170 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 FDXRP22570 491 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTGS2P35354 604 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 STT3AP46977 705 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms