RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 COMTP21964 271 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 MMP8P22894 467 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 INCA1Q0VD86 236 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ORC1Q13415 861 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.39■□□□□ 0.86
UPP1-201ENST00000331803 GRK4P32298 578 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PRMT2P55345 433 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PNKPQ96T60 521 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 FAM105AQ9NUU6 356 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CEP83Q9Y592 693 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.39■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 NDST1P52848 882 aa20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 USP38Q8NB14 1042 aa20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SCN1AP35498 2009 aa20.38■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PIRO00625 290 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CYP3A5P20815 502 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CLCN6P51797 869 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MAMLD1Q13495 774 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 FBXO47Q5MNV8 452 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CARD9Q9H257 536 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 LHX5Q9H2C1 402 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PADI3Q9ULW8 664 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CALB1P05937 261 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TRIM7Q9C029 511 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 RAB21Q9UL25 225 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SCINQ9Y6U3 715 aa20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MYO1FO00160 1098 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SPOPO43791 374 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TUBBP07437 444 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 GHRP10912 638 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 VDRP11473 427 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CD52P31358 61 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ERICH1Q86X53 443 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 HACE1Q8IYU2 909 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ALG3Q92685 438 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CD101Q93033 1021 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ZFP42Q96MM3 310 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PARVAQ9NVD7 372 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CEP350Q5VT06 3117 aa20.36■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ITGA4P13612 1032 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PAK2Q13177 524 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CNGA2Q16280 664 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 KRT35Q92764 455 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PTGESO14684 152 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PNPLA4P41247 253 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 LPIN1Q14693 890 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SGO2Q562F6 1265 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 FAM26DQ5JW98 314 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 ZNF560Q96MR9 790 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 LRRC1Q9BTT6 524 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 TRIM17Q9Y577 477 aa20.35■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PQY0 241 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 KPNA7A9QM74 516 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 PEX5P50542 639 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 BRD3Q15059 726 aa20.34■□□□□ 0.85
UPP1-201ENST00000331803 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.8 ms