RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 SETDB2Q96T68 719 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 KCNK13Q9HB14 408 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ACP6Q9NPH0 428 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 STK32BQ9NY57 414 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 PROSCO94903 275 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ZNF76P36508 570 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 PPP2R5CQ13362 524 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 LZICQ8WZA0 190 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 FAM161BQ96MY7 647 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 NDUFA13Q9P0J0 144 aa20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 AMPD1P23109 780 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MYBPC3Q14896 1274 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 OGFOD1Q8N543 542 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 OCEL1Q9H607 264 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 GMEB1Q9Y692 573 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MAGEA8P43361 318 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 ACTR3P61158 418 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 USP4Q13107 963 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 BANPQ8N9N5 519 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 CD209Q9NNX6 404 aa20.34■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 COQ9O75208 318 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 BMP3P12645 472 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 BCS1LQ9Y276 419 aa20.33■□□□□ 0.85
NOP56-201ENST00000329276 WDR91A4D1P6 747 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 K7ENM7 598 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 FCHO1O14526 889 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LIASO43766 372 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 FKBP6O75344 327 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TM7SF2O76062 418 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 IL1R1P14778 569 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CDC16Q13042 620 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 SHMT1P34896 483 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ARSEP51690 589 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ALLCQ8N6M5 410 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 NAT14Q8WUY8 206 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 HIC2Q96JB3 615 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ACCSQ96QU6 501 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GALNT8Q9NY28 637 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RABGEF1Q9UJ41 708 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 B2RBV5 119 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 C6orf229H3BNL8 230 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PSMD10O75832 226 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GPC3P51654 580 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PRELPP51888 382 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 HELQQ8TDG4 1101 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.32■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K10Q02779 954 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 GPS1Q13098 491 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 PICALMQ13492 652 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 KRT39Q6A163 491 aa20.31■□□□□ 0.84
NOP56-201ENST00000329276 AAGABQ6PD74 315 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms