RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317932.11

KCTD1-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KCTD1, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1-201ENST00000317932 NUDT17P0C025 328 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PYGMP11217 842 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CETN2P41208 172 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ACOT2P49753 483 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PPIL2Q13356 520 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CAPSQ13938 189 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TFDP1Q14186 410 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TRADDQ15628 312 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CEP57Q86XR8 500 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 FZD1Q9UP38 647 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PASKQ96RG2 1323 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 LRRC37A2A6NM11 1700 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 SBF1O95248 1867 aa11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DNM1LO00429 736 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 OGTO15294 1046 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PSTPIP1O43586 416 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ATP6V1G2O95670 118 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CAV1Q03135 178 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TAP1Q03518 808 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 POU5F1BQ06416 359 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ZNF844Q08AG5 666 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 MAPK6Q16659 721 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ODF2Q5BJF6 829 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 MON1BQ7L1V2 547 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 SHCBP1Q8NEM2 672 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC113Q9H0I3 377 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NR2E1Q9Y466 385 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 OTOFQ9HC10 1997 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 MSCO60682 206 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PROSCO94903 275 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DRD4P21917 467 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GNA15P30679 374 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 MCL1Q07820 350 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 FSTL1Q12841 308 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 NCOA4Q13772 614 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PRKG1Q13976 671 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 KCTD2Q14681 263 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 FAM228AQ86W67 206 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 RAPGEF5Q92565 580 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TLCD1Q96CP7 247 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 GPR20Q99678 358 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 HAPLN2Q9GZV7 340 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 DPH5Q9H2P9 285 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 PARVAQ9NVD7 372 aa11.12□□□□□ -0.63
KCTD1-201ENST00000317932 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms