RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 SNX25Q9H3E2 840 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 I3L4J1 428 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CALCAP01258 141 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 KIF11P52732 1056 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 RAD23BP54727 409 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 BCAR1P56945 870 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 WSCD1Q658N2 575 aa23.61■■□□□ 1.37
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CTU2-201ENST00000312060 SLC20A1Q8WUM9 679 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TMEM176AQ96HP8 235 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SUSD3Q96L08 255 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TWNKQ96RR1 684 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CWH43Q9H720 699 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 A8MXQ7 604 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 M0QZQ0 153 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GJB5O95377 273 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ODC1P11926 461 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TNFAIP3P21580 790 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ORC1Q13415 861 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TAF3Q5VWG9 929 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 UNC93AQ86WB7 457 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SYT11Q9BT88 431 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TSC2P49815 1807 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF37A1IGU5 675 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PAEPP09466 180 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ANXA13P27216 316 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SLC18A3Q16572 532 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ZBED2Q9BTP6 218 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 VWA8A3KMH1 1905 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 THAP12O43422 761 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 TRAPPC3O43617 180 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PBX3P40426 434 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CDR2Q01850 454 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ZNF677Q86XU0 584 aa23.59■■□□□ 1.37
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CTU2-201ENST00000312060 SLC9A7Q96T83 725 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 NME7Q9Y5B8 376 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 MYH10P35580 1976 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CEP290O15078 2479 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 A0A087X0T9 212 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 GABRDO14764 452 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 MMEP08473 750 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 PDGFRBP09619 1106 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 FAM228BP0C875 321 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CD19P15391 556 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 CHRNB2P17787 502 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 LMO2P25791 158 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 LHX1P48742 406 aa23.58■■□□□ 1.37
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CTU2-201ENST00000312060 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 DESI2Q9BSY9 194 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 MARCH5Q9NX47 278 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 DSEQ9UL01 958 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-201ENST00000312060 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.361e-8■■■■□ 21.8
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CTU2-201ENST00000312060 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 FMO1Q01740 532 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SPA17Q15506 151 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 METTL23Q86XA0 190 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-201ENST00000312060 DNAI2Q9GZS0 605 aa23.57■■□□□ 1.36
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