RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PALB2Q86YC2 1186 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 PMM2O15305 246 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM12O43184 909 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 KRT31Q15323 416 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 VWA3BQ502W6 1294 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 NDST4Q9H3R1 872 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D4O60343 1298 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TPM2P07951 284 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF18P17022 549 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 RAP1GAPP47736 663 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 MIIPQ5JXC2 388 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 PPFIBP1Q86W92 1011 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 VPS16Q9H269 839 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CPB1P15086 417 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CDH8P55286 799 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LRMPQ12912 555 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LIMS2Q7Z4I7 341 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OSTM1Q86WC4 334 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GCNT4Q9P109 453 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 FSD2A1L4K1 749 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C75A6NL08 312 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LINC01565O15544 149 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GLUD1P00367 558 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OR4Q2P0C623 313 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ATP1A3P13637 1013 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ASPAP45381 313 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LHX1P48742 406 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CLCN4P51793 760 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF445P59923 1031 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ROR1Q01973 937 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 EFHBQ8N7U6 833 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OR6B3Q8NGW1 331 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA18Q8TC71 538 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TATDN2Q93075 761 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SNX25Q9H3E2 840 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 CLDND1Q9NY35 253 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TACC1O75410 805 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 WEE2P0C1S8 567 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA31D3P0C874 917 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 EPCAMP16422 314 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TPM4P67936 248 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 RAB33AQ14088 237 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GBP6Q6ZN66 633 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM209Q96SK2 561 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SDCBP2Q9H190 292 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GABRDO14764 452 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 TGM5O43548 720 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 HCRTO43612 131 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 NCK2O43639 380 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 LMO3Q8TAP4 145 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 NT5C1BQ96P26 610 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 BCO2Q9BYV7 579 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXD4-201ENST00000306324 WDR27A2RRH5 827 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PDGFRBP09619 1106 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 FAM163BP0C2L3 166 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 LMO2P25791 158 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PCSK1P29120 753 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 COPB1P53618 953 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 TSPY1Q01534 308 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM15Q13444 863 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 ACBD6Q9BR61 282 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 MYH10P35580 1976 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXD4-201ENST00000306324 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms