RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ITIH4Q14624 930 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 TET3O43151 1660 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SYTL3Q4VX76 610 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 C3orf20Q8ND61 904 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 USP6NLQ92738 828 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 CNBD2Q96M20 576 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 P4HA2O15460 535 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ACADSP16219 412 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMB3Q13751 1172 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PDK1Q15118 436 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 WLSQ5T9L3 541 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 MROH9Q5TGP6 573 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 FEZF2Q8TBJ5 459 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.23■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 COPAP53621 1224 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PCSK7Q16549 785 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 MKNK1Q9BUB5 465 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PHTF1Q9UMS5 762 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PREX2Q70Z35 1606 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK10P57789 538 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 RXRBP28702 533 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-24P63145 666 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNB2Q92953 911 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 M0R3G1 203 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SP8Q8IXZ3 490 aa25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 FNTAP49354 379 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 LAYNQ6UX15 382 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 CALML6Q8TD86 181 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 WNK4Q96J92 1243 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNP10599 105 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 HORMAD1Q86X24 394 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2H1P32780 548 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC74AQ0VAA2 488 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD8Q96I13 439 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP2Q9H0W7 228 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SCN3BQ9NY72 215 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PDP2Q9P2J9 529 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPT3Q9UH03 358 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ARIH2O95376 493 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFRBP09619 1106 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 NQO1P15559 274 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA13P48723 471 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR2Q13614 643 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 EFHBQ8N7U6 833 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUD5Q96G74 571 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS33BQ9H267 617 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 PKP3Q9Y446 797 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 GLI2P10070 1586 aa25.21■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 C4orf22Q6V702 233 aa25.2■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.2■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT8Q9BYC5 575 aa25.2■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.2■■□□□ 1.63
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF263O14978 683 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 OVGP1Q12889 678 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 CNDP1Q96KN2 507 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 EXTL3O43909 919 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 RBP3P10745 1247 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIN1Q05586 938 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 VEPH1Q14D04 833 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 EPC2Q52LR7 807 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINI2O75830 405 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 ADRA2BP18089 450 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 RCN1Q15293 331 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 SCFD2Q8WU76 684 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS50Q96JG6 964 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC7Q99615 494 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.2■■□□□ 1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms