RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 DCAF15Q66K64 600 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CAPSLQ8WWF8 208 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 HACD3Q9P035 362 aa16.76■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CHN2P52757 468 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RGS21Q2M5E4 152 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF699Q32M78 642 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PGBD4Q96DM1 585 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 V9GYQ6 96 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TM9SF1O15321 606 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RIPK2O43353 540 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RAG1P15918 1043 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MAPK11Q15759 364 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MROH9Q5TGP6 573 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 AGBL1Q96MI9 1066 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MYMKA6NI61 221 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 LSM1O15116 133 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 C4BPBP20851 252 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ARMCX2Q7L311 632 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ATP7BP35670 1465 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 FCHO1O14526 889 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SNX3O60493 162 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SCNN1DP51172 638 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ERVK-9P63128 1117 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 XRCC4Q13426 336 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KRT72Q14CN4 511 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 FAM162AQ96A26 154 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CPVLQ9H3G5 476 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 FAM196BA6NMK8 535 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 IL12RB1P42701 662 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TMCO1Q9UM00 188 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.75■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 KIAA0556O60303 1618 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TRPC5OSA6NMA1 111 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 NMT2O60551 498 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 UNC5CO95185 931 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 OR8H2Q8N162 312 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RRN3Q9NYV6 651 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PAK5Q9P286 719 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SOX13Q9UN79 622 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 IGKV5-2P06315 115 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 NPEPPSP55786 919 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ITGADQ13349 1161 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PTPAQ15257 358 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PID1Q7Z2X4 250 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 VPS33BQ9H267 617 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MPP6Q9NZW5 540 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF609O15014 1411 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 M0QYV0 167 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 RALAP11233 206 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 STAT3P40763 770 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MTM1Q13496 603 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 LAMC2Q13753 1193 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 WNK4Q96J92 1243 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CEP44Q9C0F1 390 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 GALNT8Q9NY28 637 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB5O15062 677 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 WASHC5Q12768 1159 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 HMG20AQ9NP66 347 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.74■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 PSAPP07602 524 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 BGNP21810 368 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 BLVRAP53004 296 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 MAGED4Q96JG8 741 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 CD209Q9NNX6 404 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WXM4 84 aa16.73■□□□□ 0.27
CTIF-201ENST00000256413 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms