RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	UQCRB	P14927	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKCI	P41743	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SCNN1D	P51172	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC18A1	P54219	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	NR1H2	P55055	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PTK2	Q05397	1052 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MESD	Q14696	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PDK4	Q16654	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TTC8	Q8TAM2	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ART4	Q93070	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MKL1	Q969V6	931 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	2e-7	■■■■■ 27.1
PLCB1-233	ENST00000637919	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	NCAN	O14594	1321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SORBS3	O60504	671 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	AOC2	O75106	756 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ENTPD5	O75356	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MYBL1	P10243	752 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	FCER1A	P12319	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ACTN1	P12814	892 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	UCHL3	P15374	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	APBB2	Q92870	758 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	POTEC	B2RU33	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	INHBA	P08476	426 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF12	P17014	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC1A1	P43005	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	RTP1	P59025	263 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	CDK16	Q00536	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	OCA2	Q04671	838 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	KLRC3	Q07444	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	COASY	Q13057	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ALCAM	Q13740	583 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67	6e-7	■■□□□ 12.2
PLCB1-233	ENST00000637919	KLRC4	O43908	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	TRPA1	O75762	1119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	HDAC4	P56524	1084 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	INHBE	P58166	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PLCB1-233	ENST00000637919	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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