RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 BORCS6Q96GS4 357 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 PLIN2Q99541 437 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR27A2RRH5 827 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TDGF1P13385 188 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TGM1P22735 817 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TPM4P67936 248 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TSSK4Q6SA08 328 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKS3Q6ZW76 656 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 EPC1Q9H2F5 836 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 BLZF1Q9H2G9 400 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN32Q9NX65 697 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 DNM3Q9UQ16 869 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TPRP12270 2363 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 CCR2P41597 374 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MYL5Q02045 173 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAPHQ15003 741 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL4Q96EI5 215 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 UROC1Q96N76 676 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC24AO95486 1093 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM6Q14566 821 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ISM2Q6H9L7 571 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS1R3Q7RTX0 852 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ELSPBP1Q96BH3 223 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 CDT1Q9H211 546 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ABLIM1O14639 778 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM5P41594 1212 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNA5P52803 228 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD2Q13200 908 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R5AQ15172 486 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 UNC13DQ70J99 1090 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK18Q7Z418 384 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 AOPEPQ8N6M6 819 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NELL2Q99435 816 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MYMKA6NI61 221 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MOSPD3O75425 235 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G4BP0C869 781 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP1P29466 404 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MTAPQ13126 283 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM78AQ5JUQ0 283 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 DAW1Q8N136 415 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NCANO14594 1321 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1BQ00975 2339 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF2P15336 505 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN2P17706 415 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY1Q08828 1119 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF852Q6ZMS4 543 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEAL8Q8IYN2 117 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 DNASE1L2Q92874 299 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 NCDNQ9UBB6 729 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC3O43617 180 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A3P55017 1021 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM2Q14416 872 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP4K3Q8IVH8 894 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 KIFAP3Q92845 792 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB16Q96NS5 453 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-216ENST00000628306 PODXLO00592 558 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 MICAL2O94851 1124 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY5O95622 1261 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNE1P15382 129 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PROZP22891 400 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ASIC1P78348 528 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 EHHADHQ08426 723 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX12PQ92771 950 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC19Q96DA6 116 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT74Q96LB3 600 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CORO1BQ9BR76 489 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRDQ9H2X0 955 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 KCND2Q9NZV8 630 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 INSL5Q9Y5Q6 135 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 ACACBO00763 2458 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PMD0 336 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-216ENST00000628306 NPTX2P47972 431 aa26.12■■□□□ 1.77
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