RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 DSC1Q08554 894 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 STK4Q13043 487 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 TUSC3Q13454 348 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 TDGQ13569 410 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 FAM187BQ17R55 369 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 SEZ6Q53EL9 994 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 LIN9Q5TKA1 542 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 UNC13DQ70J99 1090 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 IQUBQ8NA54 791 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 KIFAP3Q92845 792 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 CDT1Q9H211 546 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 CUEDC2Q9H467 287 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 PANK4Q9NVE7 773 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 KCND2Q9NZV8 630 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.4□□□□□ -1.38
LINC00963-215ENST00000622972 CLUHO75153 1309 aa6.4□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.4□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.4□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 K7ENM7 598 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ACKR2O00590 384 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TGM5O43548 720 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 FAM13AO94988 1023 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PIGRP01833 764 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 IDEP14735 1019 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TXLNAP40222 546 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TNFSF9P41273 254 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 EFNA5P52803 228 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 OSTNP61366 133 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ASIC1P78348 528 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 GTF2BQ00403 316 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TCF15Q12870 199 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 POSTNQ15063 836 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 NAB2Q15742 525 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PSMD5Q16401 504 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CAMK4Q16566 473 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PDXDC1Q6P996 788 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 SIX5Q8N196 739 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 MYCT1Q8N699 235 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 DRC1Q96MC2 740 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TIGD1Q96MW7 591 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TCHPQ9BT92 498 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TTPALQ9BTX7 342 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 KCNK12Q9HB15 430 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 PARVGQ9HBI0 331 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 FNIP2Q9P278 1114 aa6.39□□□□□ -1.39
LINC00963-215ENST00000622972 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms