RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622045.4

SYNRG-231, Transcript of synergin gamma, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNRG, Length 3,859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNRG-231	ENST00000622045	AMPD1	P23109	780 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	STAT4	Q14765	748 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ARMCX1	Q9P291	453 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GSTA2	P09210	222 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	MYBPC2	Q14324	1141 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KRT39	Q6A163	491 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	RINL	Q6ZS11	566 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TTC1	Q99614	292 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	RALA	P11233	206 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ADRA1D	P25100	572 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ECE1	P42892	770 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CAV1	Q03135	178 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PDK4	Q16654	411 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CCDC89	Q8N998	374 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CCDC22	O60826	627 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	MTA2	O94776	668 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SPATA31D3	P0C874	917 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CCNF	P41002	786 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SEMA4D	Q92854	862 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	FAM161B	Q96MY7	647 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KRT82	Q9NSB4	513 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	BANF1	O75531	89 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	OCRL	Q01968	901 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	P3H1	Q32P28	736 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CFAP157	Q5JU67	520 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KAZN	Q674X7	775 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TTC7B	Q86TV6	843 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	BICD1	Q96G01	975 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PIK3CD	O00329	1044 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	USP1	O94782	785 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	LYN	P07948	512 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SERPINB3	P29508	390 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	RTP1	P59025	263 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	DCLK3	Q9C098	648 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TMEM150B	A6NC51	233 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PTK6	Q13882	451 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SHC3	Q92529	594 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	GATA6	Q92908	595 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	CSRNP1	Q96S65	589 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ECE2	O60344	883 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ADRB2	P07550	413 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KRT4	P19013	534 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TCEAL1	Q15170	157 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	LRRC6	Q86X45	466 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	SYNC	Q9H7C4	482 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ALCAM	Q13740	583 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		15.17	■□□□□ 0.02
SYNRG-231	ENST00000622045	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02

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