RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ARPP19P56211 112 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CYP24A1Q07973 514 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PSMD6Q15008 389 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 WDR49Q8IV35 697 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 RDH13Q8NBN7 331 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 DMAC2Q9NW81 257 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 MUTYHQ9UIF7 546 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.85■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 XYLBO75191 536 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ELF1P32519 619 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 MYBPC2Q14324 1141 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 FAM84AQ96KN4 292 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 MFSD14AQ96MC6 490 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 SIX4Q9UIU6 781 aa26.84■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CYB561D2O14569 222 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 EXOC3O60645 756 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 RBP5P82980 135 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.83■■□□□ 1.89
PMS1-220ENST00000618056 CCL16O15467 120 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TNNC2P02585 160 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 CPB1P15086 417 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PNOCQ13519 176 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 FNBP1Q96RU3 617 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 CGRRF1Q99675 332 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.82■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PRRG1O14668 218 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 SEC24AO95486 1093 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GPR17Q13304 367 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 METTL23Q86XA0 190 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 KRT19P08727 400 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 DLATP10515 647 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 ADCY1Q08828 1119 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 SCARA3Q6AZY7 606 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 SPATA20Q8TB22 786 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GSDMAQ96QA5 445 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 CYP4F11Q9HBI6 524 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GDAP2Q9NXN4 497 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 INSL5Q9Y5Q6 135 aa26.81■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 NR3C1P04150 777 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TNNI1P19237 187 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 NFIL3Q16649 462 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PTPN21Q16825 1174 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 WSCD1Q658N2 575 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 CCDC127Q96BQ5 260 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 RMND1Q9NWS8 449 aa26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 CALUO43852 315 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GPR37L1O60883 481 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 LRG1P02750 347 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 OR4Q2P0C623 313 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 THEM5Q8N1Q8 247 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 OR10T2Q8NGX3 314 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 RTP3Q9BQQ7 232 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 C11orf16Q9NQ32 467 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 POLIQ9UNA4 740 aa26.79■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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PMS1-220ENST00000618056 VNN2O95498 520 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 BFSP1Q12934 665 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 MYO1EQ12965 1108 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 SPATA18Q8TC71 538 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 EDAQ92838 391 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.78■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 HUS1O60921 280 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
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PMS1-220ENST00000618056 PDCL2Q8N4E4 241 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PLEKHO2Q8TD55 490 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PARD3BQ8TEW8 1205 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 HPDLQ96IR7 371 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 MYADMQ96S97 322 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 TMEM209Q96SK2 561 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 L1RE1Q9UN81 338 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.77■■□□□ 1.88
PMS1-220ENST00000618056 FSHRP23945 695 aa26.76■■□□□ 1.87
PMS1-220ENST00000618056 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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